Prezydent odznaczył wiceszefa BBN. Gen. Kowalski z Krzyżem Oficerskim Orderu Odrodzenia Polski

Gen. Andrzej Kowalski to oficer związany przede wszystkim ze służbami specjalnymi. Od 1994 roku służył w kontrwywiadzie Urzędu Ochrony Państwa i Agencji Bezpieczeństwa Wewnętrznego. Po zlikwidowaniu Wojskowych Służb Informacyjnych 30 września 2006 r. uczestniczył w tworzeniu nowej służby kontrwywiadowczej, Służby Kontrwywiadu Wojskowego, w której od 5 do 20 listopada 2007 r. pełnił obowiązki jej szefa. Został zdymisjonowany przez ówczesnego szefa MON Bogdana Klicha w związku z aferą wokół przeniesienia archiwum Komisji Weryfikacyjnej ds. likwidacji Wojskowych Służb Informacyjnych (WSI) do BBN.

W latach 2015-2020 pełnił funkcję szefa Służby Wywiadu Wojskowego.

Generał uchodzi za związanego z byłym szefem MON Antonim Macierewiczem. Po zapowiedziach zastąpienia gen. Kowalskiego na stanowisku szefa SWW media mówiły o nim jako o „ostatnim człowieku Macierewicza” w resorcie obrony — Macierewicza w 2018 r. zastąpił bowiem Mariusz Błaszczak. Gen. Kowalski podjął też współpracę z tzw. podkomisją smoleńską w roli eksperta, później pozytywnie wypowiadał się o jej pracach. Na chwilę przed publikacją raportu końcowego podkomisji w kwietniu 2022 r. gen. Kowalski mówił, że „hipotezę o zamachu zwalczano bardzo skutecznie przez wiele lat, a teraz dzięki podkomisji smoleńskiej znamy prawdziwe okoliczności tragedii”.

W 2023 r. gen. Kowalski wszedł w skład powołanej pod koniec rządów Zjednoczonej Prawicy budzącej kontrowersje komisji do spraw badania wpływów rosyjskich na bezpieczeństwo wewnętrzne RP w latach 2007–2022, której przewodniczącym był Sławomir Cenckiewicz. W listopadzie 2023 r. nowy Sejm, w którym prawica utraciła większość, odwołał wszystkich członków komisji, nie powołując na ich miejsce nowych.

W sierpniu 2025 r. gen Andrzej Kowalski objął stanowisko wiceszefa BBN, którym kierował Sławomir Cenckiewicz. W kwietniu br. Cenckiewicz zrezygnował z funkcji, a Kowalski objął jego obowiązki. Po nominacji na szefa BBN Bartosza Grodeckiego w maju 2026 roku ponownie został wiceszefem Biura. Bierze m.in. udział w sejmowych pracach nad projektami ustaw dot. obronności i bezpieczeństwa. 

W 1986 r. ukończył technikum w Zespole Szkół Elektronicznych przy ul. Gen. Zajączka w Warszawie, w klasie o specjalności maszyny matematyczne. Jest absolwentem Wydziału Pedagogicznego Uniwersytetu Warszawskiego, prowadził też zajęcia na Akademii Teologii Katolickiej w Warszawie.

Po studiach był współzałożycielem, działającego na zasadach eksperymentu pedagogicznego, Ośrodka Szkolno–Wychowawczego w Konstancinie–Jeziornie. Wieloletni wychowawca i nauczyciel pracujący z młodzieżą ze środowisk zagrożonych przestępczością. W latach 2011–2015 pedagog w Gimnazjum Przymierza Rodzin w Warszawie.

Jest też autorem wielu książek, w tym „Zabity za prawdę. Ks. Franciszek Blachnicki”, a także innych poświęconych tematyce pracy wywiadu i kontrwywiadu wojskowego. (PAP)